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李宜明,教授,博士生导师,斛兵学者,农产品生物化工教育部工程中心副主任,入选国家级青年人才计划。2010年博士毕业于中国科学技术大学,2010-2012年在清华大学开展博士后研究。独立工作后围绕翻译后修饰蛋白质工具的化学合成及应用开展研究。以通讯作者在Nature Commun.、J. Am. Chem. Soc.、Angew. Chem. Int. Ed.、CCS Chem.、Chem. Sci. 等期刊发表研究论文60余篇。主持/参加多项重大研究计划重点项目及面上项目,2020年获“蛋白质合成与多肽化学贡献奖”。
课题组主要研究领域为修饰蛋白工具的化学合成及应用、活性多肽的化学改性,具体方向如下:
1. 泛素家族蛋白质化学探针的合成、蛋白质组学及生物化学应用
2. 蛋白质酶促半合成新方法体系的开拓及应用
3. 药物、食品中活性多肽的结构改性
4. 非天然氨基酸的化学合成及应用
硕士招生方向:有机化学、生物化学、药学
博士招生方向:有机化学、生物化学、细胞生物学
蛋白质翻译后修饰在生物个体的发育和细胞性状的调控中均扮演了重要角色,已成为超越“中心法则”控制高等生命及人类表型的关键要素。然而运用传统的基因重组技术难以获得结构精准的翻译后修饰蛋白及携带化学基团的蛋白质工具。为解决制备翻译后修饰蛋白这一化学与生物学交叉领域亟待突破的难题,本课题组围绕“翻译后修饰蛋白的化学半合成新方法”展开系统性研究,创新性的提出了以“酶促蛋白酰肼制备”为核心的概念,发展了一套蛋白质半合成新方法体系,并运用新技术在翻译后修饰蛋白的合成及应用方向开展了系列工作,主要学术成绩包括:
1) 发现“酶促蛋白酰肼合成”新反应,建立蛋白质半合成新方法体系
a) 发现转肽酶 Sortase A 催化的蛋白酰肼合成新反应,开辟酶促蛋白质半合成新方法(Angew. Chem. Int. Ed. 2014, 53, 2198、 Chem. Sci. 2017, 8, 688);
b) 发现水解酶、 E1 连接酶催化的泛素酰肼合成新反应,拓展酶促“无痕”蛋白质半合成方法(J. Am. Chem. Soc. 2019, 141, 3654、 Angew. Chem. Int. Ed. 2020, 59, 13496 等);
2)实现修饰蛋白工具的化学半合成,探查翻译后修饰调控的生物化学事件
a) 发展泛素家族化学探针(如:泛素/SUMO 光亲和探针,泛素化组蛋白亲和探针等)
探查特异性互作蛋白组(Angew. Chem. Int. Ed. 2020, 59, 13496、CCS Chem. 2020, 2, 1157、Chem. Sci. 2020, 11, 12633);
b) 运用自噬相关翻译后修饰蛋白工具(如:p62, Atg3, LC3-II等)探查翻译后修饰调控的生物化学过程(Nature Commun. 2017, 8, 14846、Chem. Sci. 2017, 8, 688、Angew. Chem. Int. Ed. 2013, 52, 4858)
近年来,共主持多项国家自然基金项目及各类省部级项目,主要如下:
1. “酶促蛋白质半合成新方法”, 安徽省杰出青年基金,2022-2024。
2. “非经典泛素修饰蛋白的化学合成及应用”,国家自然科学基金重大研究计划重点项目,2018.01-2021.12, 合作单位负责人;
3. “泛素化肿瘤抑制因子p53 的化学合成及特异性去泛素化研究”,国家自然科学基金面上项目,2019.01-2022.12, 项目负责人;
4. “毒素蛋白探针的化学合成及其生物学应用”,国家自然科学基金面上项目,2016.01-2017.12, 项目负责人;
5. “转肽酶Sortase A催化的新反应及其在蛋白质修饰中的应用”,国家自然科学基金面上项目,2014.01-2017.12, 项目负责人;
6. “自噬小体标记蛋白LC3-II荧光衍生物的半合成及调控细胞自噬机理的研究”,国家自然科学基金青年基金,2012.01-2014.12,项目负责人
2020年获“蛋白质合成与多肽化学贡献奖”
2021年入选国家级青年人才计划
以第一作者或通讯作者共发表高水平研究论文60余篇,其中包括Nature Commun.(1篇)、J. Am. Chem. Soc.(1篇)、Angew. Chem. Int. Ed.(4篇)、CCS Chem.(1篇)、Chemical Science(4篇)等,主要代表作如下:
1. Wang, Y.; Chen, J. N.; Hua, X.; Meng, X. B.; Cai, H. Y.; Wang, R. T.; Shi, J.; Deng, H. T.; Liu, L.; Li, Y.-M.* Photocaging of Cell-permeable Activity-based Ubiquitin Probes via a C-Terminal Backbone Modification Strategy. Angew. Chem. Int. Ed. 2022, doi: 10.1002/anie.202203792.
2. Zheng, Q. Y.; Wang, T.; Chu, G. C.; Zuo, C.; Zhao, R.; Sui X.; Ye, L.; Yu, Y., Chen, J Zhang, W.; Deng, H.; Shi, J.; Pan, M.*; Li, Y.-M.*; Liu, L.* An E1-Catalyzed Chemoenzymatic Strategy to Isopeptide-N-Ethylated Deubiquitylase-Resistant Ubiquitin Probes, Angew. Chem. Int. Ed. 2020, 59, 13496-13501.
3. Wang, Y.; Chen, C. C.; Meng, X.; Fan, J.; Pan, M.; Chen, J; Deng, H.; Shi, J.*; Liu, L.; Li, Y.-M.* Chemical Synthesis of diSUMO Photoaffinity Probes for the Identification of PolySUMO-Chain Specific Interacting Proteins. CCS Chem. 2020, 3, 1157-1168.
4. Chu, G. C.;Pan, M.; Li, J.; Liu, S.; Zuo, C.; Tong, Z.-B.; Bai, J.-S.; Gong, Q.; Ai, H.; Fan, J.; Meng, X.; Huang, Y.-C.; Shi, J.; Deng, H.; Tian*, C.; Li, Y.-M.*; Liu, L.* Cysteine-Aminoethylation Assisted Chemical Ubiquitination of Recombinant Histones, J. Am. Chem. Soc. 2019, 141, 3654-3663.
5. Li, Y. T.; Yi, C.; Chen, C. C.; Lan, H.; Pan, M.; Zhang, S. J.; Huang, Y. C.; Guan, C. J.; Li, Y.-M.*; Yu, L.*; Liu, L.* A semisynthetic Atg3 reveals that acetylation promotes Atg3 membrane binding and Atg8 lipidation. Nature Commun. 2017, 8, 14846.
6. Sui, X.; Wang, Y.; Du, Y. X.; Liang, L. J.; Zheng, Q. Y.; Li, Y. M.*; Liu, L.* Development and application of ubiquitin-based chemical probes. Chem. Sci. 2020, 11, 12633.
7. Zhao, R.; Shi, P.; Chen, J. Y; Sun, S. S.; Chen, J. N.; Cui, J. B.; Wu, F. M.; Fang, G. M.; Tian, C. L.; Shi J.; Bierer, D.; Liu L.; Li, Y. M.* Chemical synthesis and biological activity of peptides incorporating an ether bridge as a surrogate for a disulfide bond. Chem. Sci. 2020, 11, 7927.
8. Tang, X. L. ; Pan, M.; Zheng, Y.; Gao, S.; Liang, L. J., Li, Y.-M.* Sortase-mediated chemical protein synthesis reveals the bidentate binding of bisphosphorylated p62 with K63 diubiquitin. Chem. Sci. 2017, 8, 6881-6887.
本课题组与清华大学、中国科学技术大学长期保持战略合作关系。
欢迎有志于化学生物学前沿交叉研究方向及继续攻读博士学位的学生加入。

